临朐县主要河流分弥河、汶河两大水系。弥河发源于沂山西麓，纵贯全县南北，出境流经青州、寿光、滨海三市（区）入海。县内全长82公里，流域面积1438平方公里，大小支流36条，计长360公里。雨季最大流量4950立方米/秒，枯季最小流量0.2立方米/秒。汶河发源于沂山东麓，向东流经沂山、蒋峪两镇（区），县境内全长约28.6公里，流域面积375平方公里，大小支流共21条，全长41.5公里，雨季最大流量505立方米/秒，枯季最小流量0.24立方米/秒。　

动物资源。临朐县在世界陆地动物区系中属古北界，动物种群以古北界动物为主，也含有东洋界成分。在中国动物地理区划中，属华北区，黄淮亚区的山东丘陵亚区。动物群落属于暖温带森林—森林草原、农田动物群。在山东省陆栖脊椎动物地理小区区划中属于鲁中南丘陵区。根据目前掌握的资料，临朐县记录野生动物（不含淡水浮游动物和鱼类）有9纲，43目，198科，876种（含亚种）。其中：陆栖脊椎动物4纲23目58科227种，陆栖无脊椎动物5纲20目140科649种。

植物资源。临朐县属泛北极植物区的中国—日本森林植物亚区，华北地区中的辽东山东半岛亚地区。在中国植被区划分为：暖温带落叶阔叶林区域—暖温带落叶阔叶林地带—南部落叶栎林亚地带—山地丘陵栽培植被—赤松麻栎林区。由于受历史上地质变动，人为生产活动的影响，县内原始植被类型已分布很少，目前主要是天然次生林和人工林。根据目前掌握的调查资料，临朐县共记录有维管植物137科，509属，929种。其中国家Ⅰ、Ⅱ级保护植物8种，列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》植物6种，山东省“稀有濒危植物”30种，分别隶属于蕨类植物门、裸子植物门、被子植物门。